La dirección superior de ASMAR corresponde al Consejo Superior, de acuerdo a lo establecido en el Artículo 9 de la Ley de ASMAR. Sus principales funciones, entre otras, son: aprobar el Plan General de Trabajos, el Plan de Inversiones y el proyecto de presupuesto anual, de conformidad con las normas legales vigentes. Aprobar las disposiciones generales para la organización y desarrollo de las actividades industriales y administrativas de ASMAR, dictar normas e instrucciones para la celebración de actos y contratos destinados a cumplir los fines de ASMAR, y pronunciarse sobre el Balance Anual del Fondo Industrial Naval y del balance anual de la actividad comercial de ASMAR.

De acuerdo con el Artículo 11 de la Ley Orgánica de ASMAR, el Ministro de Defensa Nacional y el Comandante en Jefe de la Armada, cuando lo estimen conveniente, podrán integrar el Consejo, con derecho a voz y voto, en cuyo caso presidirán la sesión, según el orden de precedencia que corresponda.

El Consejo Superior, en la actualidad, se encuentra conformado por:

Director General de los Servicios de la Armada

Sr. Leonardo Chávez Alvear

Vicealmirante

Presidente del Consejo Superior
Inicio del cargo: 17 de noviembre de 2023

Carácter Indefinido
Representante del Comandante en Jefe de la Fuerza Aérea

Sr. Fernando Mondaca Rodríguez

General de Brigada Aérea (I)

Inicio del cargo: 01 de diciembre de 2024

Carácter Indefinido
Subjefe del Estado Mayor General de la Armada

Sr. Juan Pablo Marín Fernández

Contraalmirante

Inicio del cargo: 13 de enero de 2025

Carácter Indefinido
Representante del Comandante en Jefe del Ejército

Sr. Pablo Andrés Sierra Hormazabal

General de Brigada

Inicio del cargo: 01 de diciembre de 2023

Carácter Indefinido
Director de Astilleros y Maestranzas de la Armada

Sr. José Miguel Hernández Jacir

Contraalmirante

Inicio del cargo: 29 de noviembre de 2024

Carácter Indefinido
Director de Ingeniería de Sistemas Navales

Sr. Juan Cristóbal Méndez Tapia

Contraalmirante

Inicio del cargo: 16 de noviembre de 2023

Carácter Indefinido
Director de Abastecimiento de la Armada

Sr. Marcel Fort Santander

Comodoro AB

Inicio del cargo: 25 de noviembre de 2024

Carácter Indefinido
Fiscal de Astilleros y Maestranzas de la Armada

Sr. Claudio Cereceda Valenzuela

Abogado

Inicio del cargo: 4 de enero de 2011

Carácter Indefinido